Voor de natuur zou het een zegen zijn als niet overal wordt doorgespoeld met IJsselmeerwater. Het doorspoelen zorgt er voor dat de ecologische waterkwaliteit overal slecht tot matig is. Bijzondere soorten die zich thuis voelen bij specifieke waterkwaliteit verdwijnen. Met het oog op de klimaatverandering zal de behoefte aan zoet water alleen maar toenemen, dus een nog grotere vraag naar IJsselmeerwater, terwijl er grenzen zijn aan de beschikbaarheid daarvan. Dit maakt de noodzaak des te groter om het veelvuldig doorspoelen met IJsselmeerwater terug te dringen. Dit biedt tegelijk een kans voor de natuur.
De Deltacommissie heeft aangegeven het waterpeil in het IJsselmeer te willen verhogen met max. 1,5 meter. Hierdoor zou meer zoetwater beschikbaar komen. Het is echter de vraag of het ophogen van het IJsselmeerpeil wenselijk en mogelijk is. Dit vergt een nadere uitwerking. Met het oog op onder meer toenemende verzilting en meer droge periodes in de zomer, maar ook het belang van minder doorspoelen voor de natuur, blijft aanvullend onderzoek naar de mogelijkheden om zuiniger met zoet water om te gaan van belang.
De Provincie heeft het thema ‘zoetwatervoorziening’ inmiddels opgepakt in het Provinciaal Waterplan en geagendeerd (ook bij het rijk). De Provincie gaat het thema concreet uitwerken in de vorm van functiefaciliteringskaarten (oa voor wonen, landbouw en natuur).